Die Augustinerschule verfügt über zahlreiche Fachschaften in den Bereichen Sprache, MINT, Gesellschaftswissenschaft, Musisch-Künstlerische und Sport. Innerhalb der Fachschaften findet die Gestaltung und Umsetzung des jeweiligen Faches durch die Fachlehrkräfte an der Augustinerschule statt. So werden etwa Fachcurricula entwickelt, Materialanschaffungen diskutiert, Fortbildungen vereinbart und besucht sowie besondere Projekte geplant.